Im Bereich Medizinische Mikrobiologie werden kulturelle (Anzucht und Isolierung auf Nährmedien), immunologische (Nachweis von Erreger-Antigen mittels ELISA), biochemische (z. B. artspezifische Substratverwertungsmuster), massenspektrometrische (MALDI-TOF) und molekularbiologische Verfahren (z. B. PCR mit anschließender Sequenzanalyse) zum Nachweis ätiologisch relevanter Mikroorganismen eingesetzt.

Die Anzucht und Isolierung der Keime in Reinkultur ist Voraussetzung für die Resistenztestung. Sie dient als Basis für die Beurteilung der Wirksamkeit von Antiinfektiva und somit für die Erstellung von Therapieempfehlungen. Die Resistenztestungen erfolgen nach aktuellen EUCAST Vorgaben.

Schwerpunkte in der medizinischen Mikrobiologie

• Diagnostik aerober und anaerober Bakterien aus verschiedenen Untersuchungsmaterialien unter Einsatz automatischer Systeme zur beschleunigten Befunderstellung
• Resistenztestung (Austestung verschiedener Antibiotika mittels Agardiffusion, semiautomatisierter Verfahren sowie MHK-Bestimmungen) 
• Diagnostik und Typisierung multiresistenter Erreger
• Blutkultur-Diagnostik (unter Einsatz automatischer Detektionssysteme, Resistenzschnelltestung direkt aus positiv gemeldeten Blutkulturflaschen)
• Urin-Diagnostik (einschließlich Keimzahlbestimmung)
• Diagnostik von Pilzinfektionen (Hefen, Schimmelpilze und Dermatophyten) 
• Diagnostik von Infektionen des Gastrointestinaltraktes (einschließlich Parasitosen) 
• Diagnostik opportunistischer Infektionen abwehrgeschwächter Patienten 
• Tuberkulose-Diagnostik (einschließlich NTM, molekularbiologischer und phänotypischer Resistenztestung)
• Beratung zu infektiologischen Fragestellungen, Präanalytik und Therapiemöglichkeiten- Erstellung von Erreger- und Resistenzstatistiken